A pesquisa em  Microbiologia é essencialmente experimental, envolvendo frequentemente a manipulação de materiais contaminados, muitos de origem biológica, que requerem um controle rígido na sua manipulação. Para fornecer a infraestrutura necessária às  atividades de ensino e pesquisa, o Departamento de Microbiologia estabeleceu um setor deUnidade de Processamento de Materiais (UPM) responsável pela descontaminação e esterilização de todo o material utilizado por docentes alunos e funcionários, além de realizar grande parte da lavagem e embalagem de materiais.